Golzine ist tot, die Proben von Banana Fish vernichtet. Die Gefahr ist vorüber und Eiji kehrt nach Japan zurück. Wird er Ash je wiedersehen? In gesammelten Kurzgeschichten erfährt man zudem u. a., wie einige der Hauptfiguren sich kennengelernt haben.

Es ist kein Zufall, dass sich Sei und Lin zum Verwechseln ähnlich sehen. Sie sind die einzigen Menschen auf der Welt, die durch Genmanipulation gezeugt wurden – und dazu aus derselben Eizelle. Während Lin die Nähe seines neugefundenen „Zwillingsbruders“ sucht, veranlasst Neo Genesis, Sei mit Gewalt nach Amerika zurückzuholen. Als sie Toichi entführen und als Erpressungsmittel verwenden, verliert Sei die Beherrschung: Von Zorn getrieben ist er auf Rache aus. Der zweite Band erzählt von Freundschaft, Verrat und einem unsichtbaren Band, dass zwei besondere Brüder verbindet ...

Die idyllische Insel Ogami auf Okinawa. Das Leben des zwölfjährigen Sei Arisue wird völlig auf den Kopf gestellt, als bewaffnete Männer bei ihm eindringen, seine Mutter vor seinen Augen erschießen und den Jungen entführen. Sechs Jahre später arbeitet er in Amerika für einen ausbeuterischen Pharmakonzern namens Neo Genesis. Ihm gelingt es, nach Japan zurückzukehren, wo er eine Forschungsstelle an einer Universität annimmt. Als er seine besten Freunde wiedertrifft, lernt er nach und nach, dass sein hoher IQ bei weitem nicht das einzige Ungewöhnliche an ihm ist ...

Von Hass getrieben hat sich Lin vorgenommen, die Menschheit mit einem tödlichen Virus zu „säubern“. Als Sei versucht, seine Pläne zu durchkreuzen, wird er von den Amamiyas entführt und in einem Labor von Alpha Pharmaceutical festgehalten. Dort versucht Lins Vater durch grausame Experimente mehr über den Nervenwachstumsfaktor NGF in Erfahrung zu bringen. Es stellt sich heraus, dass neben Amamiya auch Neo Genesis-Boss Goldberg sowie die Regierungen von Japan und USA in Lins „Projekt“ verstrickt sind ...